Il piccolo borgo di San Fruttuoso è situato al centro dell'Area Marina Protetta. Tra le sue rocce, sentieri scavati dall'uomo permettono ai visitatori di assaporare l'atmosfera magica della baia, in piena armonia con la natura.

La millenaria abbazia di San Fruttoso di Capodimonte risalente al XI secolo è stata di recente restaurata attraverso l'intervento del F.A.I. che ha riportato alla luce le caratteristiche originali dell'architettura romanico-gotica. Il complesso, durante i secoli, ha subito vari rimaneggiamenti ad opera della famiglia Doria che ne è rimasta proprietaria fino a pochi anni fa.
L'abbazia si può visitare da dicembre a febbraio nei giorni prefestivi e festivi dalle ore 10 alle ore 16. Nei mesi di marzo, aprile, maggio e ottobre tutti i giorni dalle ore 10 alle ore 16 ad esclusione dei lunedì non festivi e da giugno a settembre tutti i giorni dalle 10 alle  18.
Non è possibile visitare l'abbazia nel mese di novembre.
Gli orari possono subire variazioni in relazione alle condizioni del mare e l'ultimo ingresso è consentito 30 minuti prima della chiusura.
All'interno, oltre al bellissimo chiostro, sono situate le tombe dei componenti della famiglia Doria che qui hanno trovato sepoltura.

   

L'abbazia nei periodi estivi è inoltre sede di mostre e manifestazioni di rilievo.
Anche la piccola chiesa del borgo è di rilevante interesse storico e ospita una copia del Cristo degli Abissi.